Иск подали межрайонная инспекция ФНС и министерство природных ресурсов и экологии. Причиной обращения в суд стал долг в размере 222 тысяч рублей.
В 2018 году директор «Чистого города» Евгений Загуменов был осужден на три года и шесть месяцев за нарушение правил обращения экологически опасных веществ. Компания незаконно разметила около 32 тысяч отходов на нескольких территориях, не предназначенных для этого. Отходы были «Водоканала Екатеринбурга».
В 2019 году первый замглавы Екатеринбурга Александр Ковальчик был обвинен в злоупотреблении должностными полномочиями. По версии следствия, будучи директором ЕМУП «Водоканал», Ковальчик способствовал заключению договоров с «Чистым городом», который вывозил отходы на несанкционированные свалки.