По предварительным данным, перед смертью врач проходил лечение на дому, так как болел короновирусной инфекцией. Находящаяся с ним разводе, бывшая жена Евгения Завацкая обнаружила мужа в квартире уже мёртвым, а в дальнейшем разместила комментарий о том, что Сергей Завацкий болел короновирусом. Однако на связь Завацкая не выходит.
Врач урологического отделения Свердловского онкодиспасера Сергей Завацкий будет похоронен рядом с другим врачом Юрием Мансуровым, который по мнению жены также болел коронорирусом, но в официальных документах смерть наступила по иным причинам. Прощание состоится 24 июля на Широкореченском кладбище, алее врачей. Знакомые умершего, отзываются о нём как о высококвалифицированном специалисте, который помог многим людям.